Marcelo jugará en el Fluminense, el club en el que inició su carrera y desde el que dio el salto al Real Madrid. Una vez liberado por el Olympiacos, el brasileño vuelve a casa para continuar con su carrera.

El anuncio del regreso de Marcelo al Fluminense lo hizo en sus cuentas de redes sociales con las palabras "Llegó el momento de volver". Allí comenzó su carrera profesional antes de fichar por el Real Madrid en enero de 2007. Tras una carrera legendaria y cinco Champions League, el lateral izquierdo vuelve al fútbol brasileño.

Con la camiseta 'Flu', jugó una temporada en el primer equipo. En 40 partidos marcó seis goles y tres asistencias con la camiseta tricolor, antes de marcharse al Real Madrid, donde sustituyó a otro mítico brasileño, Roberto Carlos.